snapgene(引物设计软件) v1.1.3官方版 附使用教程

snapgene免费版是一款专业的DNA序列分析软件，可以帮助用户方便的分析酶切位点、标签、启动子、终止子和复制子等质粒原件，生成详细的DNA序列文件。小编还提供了snapgene使用教程，需要的朋友快快下载吧！

snapgene使用教程

View1:Map

1. 打开一个质粒图谱文件，在Topology option处选择circular。得如下界面：

View2:Sequence

点击Sequence，得到如下界面：

View3：Enzymes

点击Enzymes，得到如下界面：

View4：Features

点击Features，得到如下界面：

显示各个已命名片段的一些特点。

二、对片段进行注释

1.给编码序列命名：

点击其中一个箭头，按Feature→Add Translated Feature，弹出以下窗口：

Feature：给该片段命名。

Type：选择该片段的类型，右侧箭头代表阅读方向。 Color：选择颜色。

2. 给非编码序列命名：

如多克隆位点。先找到质粒图谱中的多克隆位点的第一个酶切位点和最后一个酶切位点。点击左侧sequence，找到两个酶切位点之间的序列。

3. 给质粒图谱增加引物序列：

按Edit→Find，输入引物序列，找到质粒序列对应位置，点击Primers→Add primer，弹出该界面：

按上下游引物选择Top Strand还是Bottom Strand，在Primer处可给该引物命名，随后即可显示该引物在图谱Map中的位置。

三、创建新DNA文件

1. 打开SnapGene，点击New DNA File，弹出以下窗口：

在Create the following sequence窗口下输入DNA序列，并对该文件命名，点击OK。或是点击Import from Genebank，输入NCBI中某序列的access number，点击OK。

2.此时弹出如下窗口：

3.对该序列进行注释：点击Features→Add Feature，对该序列进行命名注释。

△创建质粒图谱文件方法相同。

软件特点

1.轻松计划和模拟DNA操作。

2.可视化的ORF阅读框，和引物结合位点。

3.自动记录在克隆项目的步骤。

4.与其他研究人员共享注明的序列文件。

菜单中英文对照

菜单项：

1.file文件

new dna file：打开一个新的dna文件(可以选择是链状的还是环状的)

new file from selection 选取一段序列做为一个新文件

import from genbank ：输入genbank号 即可属于序列

blast ：基因序列和蛋白序列进行blast对比

2.edit编辑

copy top strand 复制顶链

copy bottom strand 复制低链

paste reverse complement 复制反向互补链

select all 全选

select range 选中你要求的序列

make uppercase 大写

make lowercase 小写

insert bases 插入基因

edit dna ends 编辑dna末端

change methylation 改变甲基化(酶切位点可能有影响)

find 查找基因序列

go to 达到对应号码的基因

3.view查看

map 显示图谱

sequence 显示序列

enzymes 显示酶切位点

features 显示特征序列

show top toolbars 显示顶部工具

show side toolbars 显示侧端工具

customize top toolbar自定义顶部工具栏

description panel 说明面板

zoom controls 焦距控制

font size 字体大小

map/sequence options 图谱和序列设定

translation options 翻译设定

flip sequence 翻转序列

set origin 设定原点

align with a sequence trace 跟另一个序列对比

4.enzymes：都是关于酶切位点的，很简单，第一次用的时候选择常用酶切位点，保存设置。

5.features

6.primers

7.actions