Vector NTI 11免费版是由Invitrogen公司开发的一款序列综合分析软件,包括对齐显示设置、模拟电泳、分析GenomBench、输出查询分子、对分子序列的操作等功能,为序列综合分析提供了新的解决方案,本站为您提供最新版本的Vector NTI 11下载,需要的朋友赶快围观吧!
软件功能
对齐显示设置——Consensus Calculation Tab
一致性序列是一个理论上有代表性的核苷酸序列,其中每个核苷酸代表在同一位点上在同一位点上经常看到的残基,或由其他标准选择。“对齐设置”对话框中的“一致性计算”选项卡指定如何以对齐方式计算对齐窗格中作为底部序列的一致序列。
模拟电泳
模拟电泳是指对DNA片段进行酶切分析后,通过电脑模拟电泳过程,将酶切片段分离。该功能有利于评估电泳时间,便于验证实际电泳结果的好坏。
分析GenomBench
genombench是Vector NTI提前的基因组项目的主力。genombench可以容纳一个碱基的基因组片段,可以检索从兼容的系统兼容的服务器上的数据,例如UCSC和Ensembl。它提供了浏览和查询这些网站使用关键词,界面两侧标记,BLAT(UCSC数据库)或SSAHA(的)。genombench还提供以下先进的搜索和分析工具,它是运行在分析监控
以点击作为特征输出查询分子
当您导出查询显示为特征的分子打成。GFF文件,使用点击功能GFF文件命令导出查询分子保存。GFF文件到外部位置(硬盘、软盘、网络等)。你可以打开一个。在一个Vector NTI分子视窗GFF文件并将其保存到Vector NTI数据库,如果需要的话。。GFF文件提供一个共享查询爆破方法打信息与其他Vector NTI用户分子格式。
对分子序列的操作
我们以一个DNA序列为例,进行一系列的常规分析;最后将此DNA序列翻译成氨基酸序列,并对此氨基酸序列进行各种分析。
Vector NTI 11安装教程
1、在本站下载Vector NTI 11免费版,解压缩,找到安装文件,点击弹出安装界面,点击【next】

2、选择我同意安装协议,然后点击【next】

3、选择文件安装目录和数据库安装目录,小编此处选择默认,想修改点击【change】,之后点击【next】

4、选择安装方式,完整版【complete】,继续next

5、选择安装组件,根据自己的需求进行勾选,继续next

6、点击【install】开始安装

7、安装完成
软件特色
关于点阵
点阵分析主要是比较两个序列来寻找所有可能的残基匹配的方法。该方法还可用于蛋白质和DNA序列中的直接或反向重复序列。它可以预测RNA中自我互补的区域,从而形成双链区或二级结构。
分析bioannotator
bioannotator是一套全面的蛋白质和核酸序列分析工具,超过五十种不同的预定义的蛋白表与特征映射和序列提供。bioannotator还提供以下先进的搜索和分析工具,它是运行在分析监控:PROSITE,Pfam,块和蛋白水解裂解。
通过Web执行分析
Vector NTI使得它很容易把你的alignx数据直接到公共网站已经建立了一个分子的三维结构,比较它与其他分子,特定功能的搜索,或进行基因预测,等等。
从AlignX出口分子
在文本窗格中选定的分子可以出口到GenBank、EMBL(GenPept蛋白质)(SWISS-PROT蛋白质),或为原序列fasta文件。若要将分子导出到外部文件,请选择项目>导出分子,并在“文件保存”对话框中选择文件类型。
比对pcr分析报告
当搜索完成时,如果您在结果选项卡上检查了生成报告选项,则对齐PCR报告预览窗口显示分析结果。比对PCR分析报告对话框的外观和功能类似于多重PCR分析报告对话框。
得分矩阵-- AlignX
设计成对序列比对评估的所有算法都是基于将分数分配给对齐残基的系统,检测不同序列之间的相似性。众所周知,某些氨基酸在其他相关蛋白质中很容易被其他氨基酸取代,这可能是因为它们具有相似的理化性质。根据氨基酸被替换为原始残基的相似性,这些“替换”被分配在矩阵中显示的分数。在对齐分数上相同或相似的残留物比那些不太相似的残留物高