FigTree软件是一款好用的进化树编辑软件,用于制作各种各样的生物进化树,可设置颜色、名称、样式等参数,支持多种形式的进化树,可帮助科研人员快速完成进化树的制作。小编还为大家准备了FigTree使用教程,需要的朋友不要错过!
FigTree使用教程
打开可执行文件,界面非常简洁
上方的几个按钮分别代表了进化树的分支合并、树枝扭转、交换,分支注释、颜色标记、查找节点等功能。
左侧的工具栏详解:
1. Layout,可以对进化树的拓扑结构、展示大小、突出显示、树根长度、角度变换
选择中间的弯弯曲曲的按钮的时候会出现圆环排列的树(颜色是自己设置的)
2. current tree, 改变当前编辑的树
3. apperance,可以改变树枝的边的颜色、粗细等
4. trees,改变树的整体拓扑结构,是否为无根树、节点是否有序排列
例如,选择Root tree:
选择Order tree:
选择transform branches:
以上三种选项还可以合并选择
5. time scale,根据分支的时间来排列树根的位置,一般用不着设置该选项
6. Tips label
标记分支的label、字体、字号、颜色等。
7. Node Labels,标记树枝上的数值的字体、颜色字号等
8. Node bars
9. Node shape,可以给分支标记的label那里添加点注释的东西
10. branch labels,是否给分支做一下标记,一般不做标记
11. Scale bar,缩放
12. scale axis,会出现对分支的一个等高线
14.legend ,选择是否出现legend,以及legend的标记范围、字体字号等。
颜色标记:
1. 对分支的名字的颜色改变:首先选择该点→选择taxa →选择Colour→选择颜色→确定
2. 对分支颜色高亮显示:首先选择该点→选择taxa →选择Highlight→选择颜色→确定
3. 对某一分支的树枝颜色的改变:首先选择想要标记的分支→选择clade→选择Colour→选择颜色→确定
4. 对某一分支的树枝背景高亮显示:首先选择想要标记的分支→选择clade→选择Hight→选择颜色→确定
更新内容
Bug修复
新功能:
节点形状选项现在可以显示内部或外部节点或两者的形状。
选择这些选项时复制选定的分类标签,选择分支时为子树。
选择“反向轴”应自动反转时间刻度比例因子。以前用户需要将其设置为-1.0。
搜索文本时,滚动显示突出显示的提示。
错误修复:
问题102:来自figtree的大型SVG文件已损坏
问题95:更改比例轴的原点值不起作用
问题94:特征图例与树重叠。
问题93:命令行PDF / SVG导出选项不起作用
问题92:使用整数和实际节点标签的混合读取文件会导致异常。
问题90:导出图片削减了最高提示标签的顶部
问题79:.SVG的导出会生成损坏的文件