Geneious v9.1.4 中文免费版

Geneious是一个跨平台的商业生物信息学软件，结合了所有主要的生物信息学分析工具，对于从事生物研究的朋友非常有用，需要的朋友不妨下载试试！

geneious 9新功能

1、序列比对和序列观看

2、Motif搜索和开放读码框(ORF)

3、进化树建设UPGMA，NJ bootstrapping和consensus trees

4、Contig assembly和色谱编辑

5、限制性内切酶分析

6、PCR引物设计

7、蛋白质结构的观看

8、整合数据库-集成检索与GenBank，PubMed，BLAST和UniProt

9、通过互联网协作和共享数据

10、生物信息教学-创建教程与直接联系的材料

11、公共API开发，由社区开发的生物信息学的免费插件

12、各种标准的生物信息学等应用工具ClustalW，MrBayes，EMBOSS,PAUP和Mauve

Geneious使用教程

安装--exe--打开geneious

初始界面如下图：

Alignment可用于比对，tree建树，assembly拼接。

序列拼接

右键点击local，创建新文件夹，测序公司提供*.abi格式文档，可直接拖动，或者file-import。

导入完成后结果如图：

为了准确可再次导入一个参考序列。

选择需要拼接的序列和参考序列进行assembly，(示例：DTH8和DTH8-13F/R)，弹出窗口

参考序列为DTH8(自动识别)，选择不要剪切----ok。拼接完成图

按住ctrl，向上滚动鼠标即可放大，与参考序列一致颜色不变

与参考序列不一致颜色蓝色

此时选择上面的峰，第一个不一致处，多出一个G，点击allow editing，光标变为绿色，将其放在consensus上，删除“-”，

下面一行的G则被删除，序列校正过后再点击allow editing，如图

下一处不同竖着看--A--A---,选择A，不需要修改。

整个序列校正完毕后，点击save。

若需要导出序列选择consensus，全选该序列，点击file-export-selected documents

软件特点

1、引物加入退化设计，不匹配处理和扩展支持

2、创建限制性内切酶列表，显示线性环状DNA和消化成片段

3、综合注释编辑和导入功能

4、微调算法快速生成准确的结果，占用更少的内存

5、VCF进口和进口压缩或gzip文件

6、罗氏454单端，双端复用数据

7、完美支持Vista/winXP/win7/win8