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snapgene引物设计详细程

2017-09-13 10:46   作者:opdown   来源:欧普软件园   浏览:541   评论:2   图片预览

snapgene一款专业的DNA序列分析软件,主要功能包括对比序列、引物设计,标签、启动子、终止子和复制子等,为了方便大家使用snapgene,小编带来了snapgene使用教程。

snapgene使用教程

View1:Map

1. 打开一个质粒图谱文件,在Topology option处选择circular。得如下界面:

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snapgene引物设计详细程

View2:Sequence

点击Sequence,得到如下界面:

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View3:Enzymes

点击Enzymes,得到如下界面:

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View4:Features

点击Features,得到如下界面:

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显示各个已命名片段的一些特点。

二、对片段进行注释

1.给编码序列命名:

点击其中一个箭头,按Feature→Add Translated Feature,弹出以下窗口:

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Feature:给该片段命名。

Type:选择该片段的类型,右侧箭头代表阅读方向。 Color:选择颜色。

2. 给非编码序列命名:

如多克隆位点。先找到质粒图谱中的多克隆位点的第一个酶切位点和最后一个酶切位点。点击左侧sequence,找到两个酶切位点之间的序列。

3. 给质粒图谱增加引物序列:

按Edit→Find,输入引物序列,找到质粒序列对应位置,点击Primers→Add primer,弹出该界面:

snapgene引物设计详细程

按上下游引物选择Top Strand还是Bottom Strand,在Primer处可给该引物命名,随后即可显示该引物在图谱Map中的位置。

三、创建新DNA文件

1. 打开SnapGene,点击New DNA File,弹出以下窗口:

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在Create the following sequence窗口下输入DNA序列,并对该文件命名,点击OK。或是点击Import from Genebank,输入NCBI中某序列的access number,点击OK。

2.此时弹出如下窗口:

snapgene引物设计详细程

3.对该序列进行注释:点击Features→Add Feature,对该序列进行命名注释。

△创建质粒图谱文件方法相同。

snapgene引物设计详细程欧普下载整理并发布,欢迎转载!

Tags:责任编辑:lmj
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